Musim 3 adalah musim terakhir dari seri. Musim ini diisi dengan aksi yang lebih dikemas dan komedi lebih. Ini lebih berfokus pada petualangan yang dimiliki BoBoiBoy dan teman-temannya di sekitar Pulau Rintis. Musim ini dimulai dengan pertarungan BoBoiBoy dengan Ejo Jo, yang merupakan kelanjutan dari Episode Terakhir Musim 2.
Episode[]
| No. dalam Seri | No. dalam Musim | Judul Episode | Tanggal Siaran TV3 | Tanggal Siaran MNCTV | Tanggal Siaran Online |
|---|---|---|---|---|---|
| 27 | 1 | "BoBoiBoy vs Ejo Jo Bagian 1" | 5 Januari 2014 | 31 Oktober 2014 | 19 Desember 2014 |
| 28 | 2 | "BoBoiBoy vs Ejo Jo Terakhir" | 12 Januari 2014 | 31 Oktober 2014 | 19 Desember 2014 |
| 29 | 3 | "Probe dalam Ingatan" | 19 Januari 2014 | November 2014 | 19 Desember 2014 |
| 30 | 4 | "Kerja Sama BuBaDiBaKo" | 26 Januari 2014 | November 2014 | 19 Desember 2014 |
| 31 | 5 | "Amukan Koko Jumbo" | 2 Februari 2014 | November 2014 | 19 Desember 2014 |
| 32 | 6 | "Layanan Wak Baga Ga" | 4 Desember 2014 | Desember 2014 | 19 Desember 2014 |
| 33 | 7 | "Perampokan Rob, Robert, & Roberto" | 8 Desember 2014 | Desember 2014 | 19 Desember 2014 |
| 34 | 8 | "5 Komander Scammer" | 9 Desember 2014 | Desember 2014 | 19 Desember 2014 |
| 35 | 9 | "Pertarungan di Bulan" | 10 Desember 2014 | Desember 2014 | 19 Desember 2014 |
| 36 | 10 | "Papa Zola & Mama Zila" | 11 Desember 2014 | Desember 2014 | 19 Desember 2014 |
| 37 | 11 | "Serangan Mama Zila" | 15 Desember 2014 | Desember 2014 | 20 Desember 2014 |
| 38 | 12 | "Ketibaan Ibu Adu Du" | 16 Desember 2014 | Desember 2014 | 20 Desember 2014 |
| 39 | 13 | "Adu Du Kembali Jahat" | 17 Desember 2014 | 1 Januari 2015 | 20 Desember 2014 |
| 40 | 14 | "Robot Pango dan Raksasa Bawang" | 1 Januari 2015 | 1 Januari 2015 | 26 Desember 2014 |
| 41 | 15 | "Misteri Pembakar Api" | 1 Februari 2015 | 1 Februari 2015 | 16 Januari 2015 |
| 42 | 16 | "Bahaya BoBoiBoy Api!" | 29 Maret 2015 | 15 Februari 2015 | 5 Februari 2015 |
| 43 | 17 | "BoBoiBot Bersiap" | 7 Juni 2015 | 29 Maret 2015 | 12 Maret 2015 |
| 44 | 18 | "Bahagia Bersama BoBoiBot" | 18 Juni 2015 | 19 April 2015 | 3 April 2015 |
| 45 | 19 | "Kejutan BoBoiBoy Air" | 11 Oktober 2015 | 18 Oktober 2015 | 30 September 2015 |
| 46 | 20 | "Kebangkitan BoBoiBoy Air" | 17 Desember 2015 | 1 Januari 2016 | 11 Desember 2015 |
| 47 | 21 | "Episode Khusus: Jagalah Bumi (Bagian 1)" | 18 Desember 2015 | 4 Januari 2016 | 17 Desember 2015 |
| 48 | 22 | "Episode Khusus: Jagalah Bumi (Bagian 2)" | 19 Desember 2015 | 5 Januari 2016 | 21 Desember 2015 |
| 49 | 23 | "Episode Khusus: Jagalah Bumi (Bagian 3)" | 20 Desember 2015 | 6 Januari 2016 | 25 Desember 2015 |
| 50 | 24 | "Musuh Baru dan Lama" | 28 Mei 2016 | 29 Mei 2016 | 8 April 2016 (Bagian 1) 16 April 2016 (Bagian 2) |
| 51 | 25 | "Antara Teman dan Musuh" | 4 Juni 2016 | 1 Juni 2016 | 11 Mei 2016 (Bagian 1) 21 Mei 2016 (Bagian 2) |
| 52 | 26 | "Jumpa Lagi BoBoiBoy" | 11 Juni 2016 | Tidak ada | 11 Juni 2016 |
Trivia[]
- Musim ini berakhir pada 11 Juni 2016.
- Pada tanggal 1 Januari 2015, jumlah episode di Musim 3 diperpanjang dari 18 menjadi 26 episode.
- Seperti di musim sebelumnya, terjadi perubahan pakaian BoBoiBoy, Ying, Yaya dan Gopal, Fang tanpa jaket di musim ini.
- Yap Ee Jean menggantikan Yvonne Chong Shin Vun sebagai pemain suara Komputer sejak Musim 3, Episode 3.
- Dalam Musim 3, Episode 14, sutradaranya hanya Yap Ee Jean.
- Awal Musim 3, Episode 6, judul episode resmi ditunjukkan setelah kilas balik.
- Awal Musim 3, Episode 14, Kee Yong Pin menggantikan Nizam Razak sebagai Editor.
- Latar belakang kredit menunjukkan BoBoiBoy, Gopal, Papa Zola, Adu Du dan Probe didalam permainan Papa Zola 5: Kebenaran di Lorong Kegelapan (Musim 1, Episode 7).
- Dalam musim ini, 3 relasi karakter membuat penampilan pertama kali mereka. kakak laki-laki Bago Go, Wak Baga Ga, Bagi Gi, Bagu Gu, dan Tom ditampilkan dalam Episode 8; ibu Adu Du, Ibu Bu dalam Episode 12 dan juga kakak laki-laki Fang, Kapten Kaizo dalam Episode 20.
- Dari rencana semula, episode diperkirakan akan ditayangkan dalam empat bulan terpisah (lima episode untuk bulan Januari, empat episode untuk bulan Juni, empat episode untuk bulan September dan lima episode untuk Desember dan delapan episode secara acak) namun karena penundaan yang sangat besar terjadi antara bulan Juni sampai Desember 2014 dan April sampai Juni 2015, semua episode diluncurkan pada:
- Episode 1 ke 5 ditayangkan pada Januari 2014
- Episode 6 ke 14 ditayangkan pada Desember 2014
- Episode 15 ke 16 ditayangkan pada Februari 2015
- Episode 17 ditayangkan pada Maret 2015
- Episode 18 ditayangkan pada April 2015
- Episode 19 ditayangkan pada September 2015
- Episode 20 ke 23 ditayangkan pada Desember 2015
- Episode 24 ditayangkan pada April 2016
- Episode 25 ditayangkan pada Mei 2016
- Episode 26 ditayangkan pada Juni 2016